ETCゲート通過時に通常料金が表示されましたが、高速道路周遊パスが使えないのでしょうか。

実際の走行では、ETCゲート通過時には通常料金が表示されます。
高速道路周遊パスのお申し込みが完了していて、対象の走行であれば、ETCカードのご利用精算時に高速道路周遊パスの定額料金で精算されます（カードの利用明細でご確認ください）。